Pracownia Patomorfologii wykonuje diagnostykę histopatologiczną dla potrzeb Przychodni Specjalistycznej, Klinik Instytutu i wielu innych placówek służby zdrowia.

Jest to również ośrodek konsultacyjny dla całego kraju w zakresie szeroko pojętej diagnostyki histopatologicznej i immunohistochemicznej chorób układu chłonnego i krwiotwórczego ( hematopatologii ). Dziedzina ta obejmuje zmiany zapalne, odczynowe i nowotworowe węzłów chłonnych ( ziarnica złośliwa i chłoniaki ) oraz zmiany histopatologiczne w trepanobiopsjach szpiku w przebiegu chorób hematologicznych oraz w innych chorobach ogólnoustrojowych powodujących wtórne zmiany w szpiku.